Mikroben-Kohlenhydrat-Interaktionen

Forschung

Unser Forschung Ziel ist die phänotypisierung von bakteriellen Mikrobiomen zur Identifizierung physiologischer Fähigkeiten und Quantifizierung der Heterotrophie in situ.

Einfach ausgedrückt haben wir mit unserer Forschung das Ziel die Mechanismen zu entdecken die Bakterien verwenden um komplexe Zucker abzubauen, und die auswirkungen von dieser Aktivität auf die Umgebung zu beschrieben. Zum Beispiel den Abbau von Zucker in den Ozeanen und wie dies den globalen Kohlenstoffkreislauf beeinflusst, oder den Abbau von Zucker in menschlichen und tierischen Verdauungssystemen und wie dies die Gesundheit beeinflusst. Wir möchten die Analyse der mikrobiellen Heterotrophie neu definieren, indem wir neue kulturunabhängige Ansätze verwenden, um die Phänotypen von Mikroorganismen zu untersuchen. Zum Beispiel verwenden wir fluoreszierende Substrate, um den mikrobiellen Stoffwechsel in Bakterien zu beobachten (Oben mittleres Bild). Die Arbeitsgruppe benutzt diverse Methoden aus den Bereichen Molekulare Ökologie (DNA-Extraktion, PCR, Diversitätsanalyse durch 16S rRNA, Metagenomik, FISH und Mikroskopie), Mikrobiologie (Kultivierung, Wachstumskurven, Stoffwechselanalyse) und Glykobiologie (Kohlenhydratextraktionen, Zuckeranalyse und Produktion von fluoreszierender Zucker).

Wir werden mit unserer Forschung herausfinden wie einzelne Mikroorganismen unterschiedliche bakterielle Nahrungssuchmechanismen verwenden, um Polysaccharide abzubauen, und wie sich dies auf die Substratverfügbarkeit für die breitere Mikrobengemeinschaft auswirkt.